Fundacja powstała w 1993 roku z inicjatywy pracowników naukowych wyższych uczelni
(w większości profesorów nauk humanistycznych) oraz wydawców literatury naukowej.
Główne kierunki jej aktywności:
- wspieranie badań naukowych w zakresie szeroko pojętej humanistyki,
zwłaszcza takich dyscyplin, jak: filozofia, kulturoznawstwo, pedagogika, psychologia, socjologia i religioznawstwo
- działalność wydawnicza – Wydawnictwo Fundacji Humaniora specjalizuje się w zakresie niskonakładowej literatury naukowej z wymienionych dyscyplin
- promocja wyników badań naukowych oraz nowości wydawniczych
- organizacja spotkań naukowych, w tym konferencji i seminariów – wspieranie instytucji związanych z obiegiem i upowszechnianiem książki naukowej, w tym bibliotek uczelnianych
Naczelnym organem kierującym Fundacją jest Zarząd, natomiast jej organami kolegialnymi są Rada Fundacji oraz Komisja Rewizyjna.
